Сержант Кэроро: Кэроро против Тёмного Кэроро — Великая битва за небо!

Фильм начинается с того, что Фуюки Хината и отряд Кероро исследуют заброшенный храм на вершине горы в перуанском городе Мачу-Пикчу. Во время исследования Кероро случайно активирует ловушку, и они обнаруживают тайную комнату с большим синим кристаллом на постаменте, в котором вставлен ключ. Кероро наклоняется на ключ, запуская загадочный механизм, из-за чего храм начинает трястись. Осознав происходящее, группа спешит покинуть комнату. В суматохе Кероро теряет свой Керо Болл, а Фуюки мельком видит светящуюся молодую женщину, но не успевает ничего сказать, так как они вынуждены бежать.

Группе удается выбраться, а девушка, у которой появляются светящиеся крылья, наблюдает за их уходом. Тем временем, внутри кристалла в комнате начинает что-то расти...