Ра-Зефон

Обычная жизнь старшеклассника Аято Камины переворачивается с ног на голову, когда Токио неожиданно атакуют футуристические истребители. В разгар хаоса он встречает женщину по имени Харука Шитоу, которая утверждает, что работает на правительственную организацию TERRA. Она рассказывает ему, что он живет в временном пузыре под названием "Токио Юпитер", созданном муллианами — гуманоидами из другого измерения, чтобы изолировать и захватить Токио. TERRA пытается прорваться через барьер вокруг города с тех пор, как это случилось. Не в силах осознать услышанное, Аято в панике убегает и натыкается на свою одноклассницу Рейку Мишиму, которая ведет его к месту под названием "Святилище Ксефон", где покоится огромное яйцо. Она начинает петь, и в Аято пробуждается неизвестная сила, связывающая его с существом по имени РахКсефон, которое вылупляется из яйца. Вскоре Харука снова находит его и пытается убедить присоединиться к борьбе против муллиан.

Оказавшись между огнем муллиан и TERRA, Аято начинает задаваться вопросами о своем предназначении, пытаясь разобраться в измененных воспоминаниях и, в конечном итоге, в своей собственной личности в этом хаотичном новом мире.