Хаос; Вершина

Семнадцатилетний Такуми Нисидзё ведёт замкнутый образ жизни, большую часть времени проводя в грузовом контейнере на крыше здания в районе Сибуя. Он увлечён компьютерными играми, аниме и сетевыми форумами, практически не взаимодействуя с окружающими. Такуми убеждён, что рядом с ним находится воображаемая девушка Сэйра, существующая исключительно в его восприятии. Реальный мир он называет «трёхмерным» и старается избегать социальных контактов, ограничиваясь редкими посещениями школы.

В учебном заведении подросток узнаёт о серии жестоких преступлений, получивших название «НьюГен». События сопровождаются странными совпадениями и жестокими сценами, которые начинают вторгаться в повседневность Такуми. Он становится свидетелем убийства, однако не уверен в достоверности увиденного. После этого к нему обращается загадочная девушка Рими Сакэхаси, утверждающая, что знает о его причастности к происходящему. Реальность постепенно искажается, галлюцинации смешиваются с фактами, а границы восприятия размываются.