Девочка-волшебница Мадока★Волшебный фильм 3: История восстания

После переписывания законов мироздания Мадокой система ведьм исчезает, однако вместо них возникают призраки — сущности, рождающиеся из человеческого отчаяния и нападающие на города. Девочки-волшебницы продолжают боевые вылазки, очищают искажения, используют кристаллы для стабилизации собственных сил, действуя под наблюдением инкубаторов. Хомура участвует в патрулях вместе с другими обладательницами контрактов, но замечает несоответствия в устройстве окружающей реальности и повторяющиеся события с разными деталями.

Во время одной операции она фиксирует временной разрыв, после которого пространство перестраивается, а знакомые личности ведут себя иначе, чем прежде. Попытка расследования приводит её к обнаружению искусственно созданного барьера, внутри которого заключено несколько волшебниц и изолирован наблюдатель-инкубатор. Выясняется, что экспериментаторы пытаются изучить закон новой вселенной, отделив одну из участниц и поместив её в контролируемую среду с поддельными воспоминаниями. Хомура восстанавливает утраченную память, понимает природу ловушки и разрушает структуру барьера через трансформацию собственной силы.