Евангелион нового поколения: Смерть и перерождение

Организация NERV ведёт оборону Земли от существ, называемых Ангелами, используя гигантские биомеханические единицы «Евангелион», синхронизируемые с подростками-пилотами через нейронный интерфейс. Синдзи Икари по приказу отца прибывает в Токио-3 и становится оператором боевой машины после ранения предыдущего кандидата во время атаки. Управление требует психологической совместимости, поэтому каждая битва сопровождается перегрузками, потерей контроля и прямым воздействием боли на пилота. Параллельно служба скрывает происхождение проектов, источники энергии, истинную природу противников и назначение тайного плана комплементации человечества.

Рей Аянами участвует в операциях как резервный пилот, связанный с руководством особым происхождением и серией секретных замен. Аска Лэнгли Сорью прибывает из зарубежного подразделения, демонстрирует высокий коэффициент синхронизации и агрессивный стиль боя против Ангелов. Внутри штаба происходят конфликты между отделами, утечки данных, попытки внешних комитетов получить контроль над разработками. Сражения показывают разные типы врагов: летающие формы, психические атаки, проникновение внутрь защитных барьеров, заражение систем управления.