Добро пожаловать в класс превосходства 4: Второй год — Первый семестр
Киётака Аянокодзи переходит на второй год обучения в элитной академии, где система баллов, экзаменов и скрытых правил продолжает определять положение учеников и их шансы на дальнейшее существование в школе. С началом нового семестра администрация вводит усложнённые испытания, в которых классы вынуждены соревноваться через многоуровневые задания, стратегические игры, коллективные проекты и психологические проверки, направленные на выявление слабых звеньев. Временно исполняющий обязанности директора Токинари Цукисиро напрямую вызывает Киётака.
Сообщает о необходимости вычислить нового ученика, прибывшего из Белой Комнаты, поскольку его присутствие может дестабилизировать баланс и привести к неконтролируемым последствиям. Условие оказывается жёстким: если Киётака не сумеет выполнить задание, его исключат, лишив возможности продолжать обучение. По мере развития событий Киётака начинает анализировать поведение новых студентов, отслеживать аномальные реакции, проверять совпадения в результатах экзаменов, устраивать проверочные ситуации, чтобы выявить человека, прошедшего аналогичную подготовку.